Dalam memenuhi dan menjamin mutu layanan kepada masyarakat, Balai Labkesmas Papua menetapkan Standar Pelayanan sebagai pedoman penyelenggaraan pelayanan dan acuan penilaian kualitas pelayanan.

Penentuan tarif pelayanan Balai Labkesmas Papua dituangkan sesuai dengan surat edaran nomor HK.02.03/XI.11/1503/2024 tentang penetapan Jenis dan Tarif Atas Layanan PNBP (Pendapatan Negara Bukan Pajak) yang Berlaku di Lingkungan Balai Laboratorium Kesehatan Masyarakata Papua.